дт 76 кт 86 — утверждено/начислено финансирование за счет ФСС — 8000р.
дт 51 кт 76 — ФСС вернуло 5000р.
дт 69.01 кт 76 — списаны средства в счет уплаты ФСС — 3000р.
дт 60 кт 51 — оплачены медицинские услуги — 8000р.
дт 86 кт 60 — списаны средства за счет ФСС — 8000р.

1. Что бы сформировать баланс необходимо сделать так называемое «закрытие года/свернуть счета», т.е определить прибыль/убыток текущего года. ДТ 84 КТ 99 -50 709,38р.
2. Сделать зачет авансов. У вас на 62.1 и 62.2 одна и та же сумма 67 400. По факту задолженность 0.
3. У вас не закрыта задолженность учредителей по взносам в Уставной капитал. Учредители обязаны внести 15000 на р/с организации.
В соответствии с пунктом 3 статьи 90 ГК РФ и пунктом 2 статьи 16 Закона № 14-ФЗ уставный капитал общества с ограниченной ответственностью должен быть оплачен учредителями на момент регистрации не менее чем наполовину. После внесения денежных средств банк, в котором в целях оплаты уставного капитала открыт накопительный счет, выдает обществу справку о том, что уставный капитал сформирован на 50 процентов. Данную справку общество представляет регистрирующему органу вместе с другими необходимыми документами.
При этом оставшаяся неоплаченной часть уставного капитала общества с ограниченной ответственностью подлежит оплате его участниками в течение одного года с момента государственной регистрации общества. Если в установленный срок вклады не внесены, общество должно либо объявить об уменьшении своего уставного капитала и зарегистрировать его уменьшение в установленном порядке, либо прекратить свою деятельность путем ликвидации (п. 3 ст. 90 ГК РФ).

Баланс примерный ( у вас оборотка не верная): 
Актив:
Денежные средства — 39 560
Дебиторская задолженность — 15 000 (не закрыли УК) +106
НДС — 12 132
Итого актив: 66 798
Пассив:
Уставной капитал — 15 000
Прибыль — 7034,66 вместо (50 709,38)
Кредиты и займы полученные — 37 000
Кредиторская задолженность - 2 885,34 + 3 960+ 918
Итого пассив: 66 798

Прибыль взяла расчетную, так как у вас неправильная оборотка (нужно проверять) ДТ не сходится с КТ — а значит есть где то ошибки.
Например итог 68 счета -2 885,34, из них КТ 2 340 — ДТ 12 132, не идет на - 12 677,34!

Попробуйте тут: Документ «Методические положения…..» реализуется на договорных условиях. Справки по тел. 217-35-34, 217 38-95; факс 217-35-17 ,215-77-04  
www.mineral.ru/News/1302.html

Вы правы.
Существуют 2 способа перевыставления услуг:
1. по агентскому договору в данном случае подрядчик предоставляет вам отчет агента в котором указывает перевыставленную услугу без НДС, отдельной строкой указывается вознаграждение с НДС. При это в подтверждение перевыставления он прикладавает к отчету агента копию с-ф первичного поставщика.
2. по договору купли продажи — в данном случае от приходует услуги (без НДС) у себя как расходы, а реализацию вам оформляет от своего имени с НДС.
Если поставщик (исполнитель) находится на ОСНО, то он не может выставить счета клиентам без НДС. Исключение — операции не попадающие под обложение НДС, прописанные в 149 ст. НК РФ. В любом случае доход посредника облагается НДС, а вот в полной сумме услуг или в размере своего вознаграждения зависит от формы договора: договор оказания услуг или агентский.

ч. «б» пп. 9 п. 1 ст. 1 Федерального закона от 10.12.2003  О ВАЛЮТНОМ РЕГУЛИРОВАНИИ И ВАЛЮТНОМ КОНТРОЛЕ, гласит: приобретение резидентом у нерезидента либо нерезидентом у резидента и отчуждение резидентом в пользу нерезидента либо нерезидентом в пользу резидента валютных ценностей, валюты Российской Федерации и внутренних ценных бумаг на законных основаниях, а также использование валютных ценностей, валюты Российской Федерации и внутренних ценных бумаг в качестве средства платежа — является валютной операцией.
Т.е Если нерезидент перечисляет резиденту РУБЛИ (в данном случае делает взнос в УК) — это валютная операция. 
ч. 2 ст. 14 Федерального закона № 173-ФЗ гласит: Если иное не предусмотрено настоящим Федеральным законом, расчеты при осуществлении валютных операций производятся юридическими лицами — резидентами через банковские счета в уполномоченных банках,  порядок открытия и ведения которых устанавливается Центральным банком Российской Федерации, а также переводами электронных денежных средств.
Т.е. валютные операции совершаются только перечислением между уполномоченными банками.
Значит Учредитель-нерезидент может внести УК (даже в рублях) только перечислением в банк. Для этого он должен открыть (или иметь) счет в уполномоченном банке.