Хочу открыть ИП но есть задолженость по кредиту, Это как-то повлияет на решение налоговой?
Никак не повлияет. Ваше решение носит уведомительный характер. И запретить Вам заниматься предпренимательской деятельностью в праве только суд и то в рамках установленных законодательством.