Здравствуйте.
Можете. Но помимо регистрации как юридическое лицо вам нужно будет получить лицензию на фармацевтическую деятельность.Ее выдает Росздравнадзор. Думаю, лучше позвонить (сходить) туда за консультацией
Ознакомьтесь:
Федеральный закон от 12.04.2010 N 61-ФЗ (ред. от 22.10.2014) «Об обращении лекарственных средств» (с изм. и доп., вступ. в силу с 01.01.2015)
Приказ Минздравсоцразвития РФ от 27.07.2010 N 553н
«Об утверждении видов аптечных организаций»
(Зарегистрировано в Минюсте РФ 08.09.2010 N 18393)